Execution times

Species

KEGG code

Total running time

δG=0, δD=0

δG=0, δD=1

δG=0, δD=2

δG=0, δD=3

δG=1, δD=0

δG=1, δD=1

δG=1, δD=2

δG=1, δD=3

δG=2, δD=0

δG=2, δD=1

δG=2, δD=2

δG=2, δD=3

δG=3, δD=0

δG=3, δD=1

δG=3, δD=2

δG=3, δD=3

Escherichia coli

eco

1h 35min 54s

05min 21s

15min 54s

11min 01s

01min 24s

03min 46s

04min 20s

03min 46s

05min 32s

03min 45s

04min 51s

03min 40s

05min 22s

03min 47s

04min 59s

03min 54s

14min 32s

Yersinia pestis

ype

1h 18min 12s

05min 21s

15min 57s

10min 59s

01min 07s

02min 25s

03min 11s

03min 08s

07min 29s

02min 27s

03min 24s

03min 20s

07min 34s

02min 42s

03min 34s

03min 30s

02min 04s

Vibrio cholerae

vco

57min 54s

05min 16s

10min 59s

05min 44s

57s

01min 32s

02min 15s

01min 54s

03min 24s

01min 32s

02min 12s

03min 21s

08min 07s

01min 45s

02min 27s

03min 36s

02min 55s

Shewanella putrefaciens

spc

2h 05min 46s

05min 17s

11min 05s

06min 04s

20min 38s

02min 17s

02min 54s

13min 51s

10min 11s

02min 19s

03min 23s

18min 26s

05min 09s

02min 20s

03min 27s

13min 16s

05min 10s

Pseudomonas aeruginosa

pae

1h 48h 07s

10min 22s

06min 09s

06min 33s

03min 03s

05min 52s

06min 18s

06min 03s

08min 51s

05min 45s

06min 13s

06min 01s

08min 51s

05min 46s

06min 55s

06min 42s

08min 42s

Xylella fastidiosa

xfa

19min 55s

09s

25s

48s

01min 06s

45s

01min 01s

01min 29s

02min 34s

44s

01min 01s

01min 28s

02min 36s

46s

01min 04s

01min 31s

02min 28s

Ralstonia solanacearum

rso

2h 09min 04s

05min 19s

11min 06s

12min 59s

07min 54s

02min 41s

08min 28s

16min 44s

06min 15s

02min 38s

03min 23s

16min 30s

06min 08s

02min 39s

03min 28s

16min 40s

06min 10s

Neisseria meningitidis

nme

29min 15s

08s

01min 45s

05min 15s

01min 01s

37s

05min 38s

01min 03s

01min 49s

37s

39s

01min 21s

03min 26s

37s

40s

01min 24s

03min 17s

Acidithiobacillus ferrivorans

afi

1h 23min 10s

09s

25s

07min 15s

07min 26s

01min 12s

08min 05s

17min 15s

02min 58s

01min 21s

07min 52s

02min 43s

06min 36s

03min 27s

07min 54s

06min 59s

01min 36s

Agrobacterium radiobacter

ara

1h 46min 21s

01min 03s

20min 33s

05min 54s

05min 48s

05min 27s

04min 47s

05min 45s

09min 53s

05min 27s

04min 58s

05min 49s

04min 52s

05min 31s

09min 55s

05min 42s

04min 58s

Rickettsia rickettsii

rrj

03min 43s

05s

04s

05s

12s

13s

32s

11s

12s

31s

13s

29s

Geobacter sulfurreducens

gsu

48min 28s

11s

45s

05min 36s

07min 57s

01min 14s

07min 20s

06min 11s

01min 15s

01min 16s

02min 23s

01min 28s

01min 33s

01min 15s

06min 54s

01min 35s

Nitrospira defluvii

nde

1h 16min 39s

05min 12s

06min 30s

10min 45s

01min 09s

01min 50s

08min 01s

04min 46s

08min 17s

01min 49s

03min 12s

04min 40s

03min 09s

01min 50s

07min 34s

04min 55s

02min 59s

Acidobacterium capsulatum

aca

38min 19s

10s

05min 13s

16s

19s

02min 09s

02min 16s

07min 13s

02min 18s

02min 13s

02min 17s

02min 10s

02min 15s

02min 11s

02min 18s

02min 28s

02min 33s

Desulfurispirillum indicum

din

26min 50s

05min 09s

10min 11s

11s

14s

52s

54s

56s

58s

52s

56s

52s

54s

58s

59s

Fusobacterium nucleatum

fnu

17min 08s

12s

05min 22s

36s

49s

30s

41s

01min 01s

01min 11s

30s

42s

58s

01min 09s

31s

43s

01min 03s

01min 11s

Denitrovibrio acetiphilus

dap

34min 46s

09s

05min 25s

05min 22s

27s

01min 02s

06min 15s

01min 16s

02min 36s

01min 04s

01min 15s

01min 14s

02min 30s

01min 03s

01min 13s

01min 16s

02min 37s

Thermodesulfatator indicus

tid

08min 20s

07s

08s

10s

13s

36s

35s

39s

42s

36s

37s

38s

42s

36s

37s

40s

42s

Aquifex aeolicus

aae

06min 57s

05s

06s

07s

27s

28s

47s

28s

27s

28s

47s

28s

29s

48s

Bacillus subtilis

bsu

1h 30min 30s

05min 21s

06min 35s

07min 06s

07min 35s

02min 43s

04min 35s

06min 24s

06min 59s

02min 45s

04min 50s

06min 34s

07min 01s

02min 46s

04min 46s

06min 58s

07min 32s

Listeria monocytogenes

lmo

1h 12min 38s

54s

11min 28s

11min 50s

02min 19s

02min 02s

07min 24s

02min 41s

03min 16s

02min 04s

02min 19s

02min 51s

05min 50s

06min 25s

02min 26s

03min 01s

05min 49s

Staphylococcus aureus

53min 47s

05min 11s

06min 19s

11min 39s

01min 53s

01min 01s

02min 09s

02min 47s

03min 05s

01min 00s

02min 06s

02min 45s

03min 06s

01min 01s

02min 11s

02min 51s

04min 44s

Lactobacillus acidophilus

lac

16min 06s

07s

24s

05min 22s

28s

48s

44s

01min 17s

28s

45s

42s

01min 14s

28s

49s

44s

01min 17s

Streptococcus pneumoniae

snd

39min 17s

19s

10min 17s

53s

01min 50s

01min 02s

48s

06min 31s

01min 47s

01min 07s

52s

06min 30s

01min 43s

01min 13s

56s

01min 34s

01min 55s

Clostridium perfringens

cpe

50min 16s

12s

05min 18s

32s

03min 20s

01min 02s

02min 54s

06min 14s

05min 28s

01min 03s

02min 56s

06min 05s

04min 55s

01min 03s

03min 02s

01min 07s

05min 06s

Mycoplasma pneumoniae

mpn

07min 06s

04s

18s

14s

16s

06s

20s

50s

51s

06s

20s

48s

49s

06s

20s

50s

48s

Synechocystis sp.

syn

18min 30s

08s

09s

10s

11s

01min 30s

01min 25s

01min 31s

01min 34s

01min 31s

01min 27s

01min 26s

01min 30s

01min 29s

01min 28s

01min 31s

Prochlorococcus marinus

pma

08min 40s

08s

09s

10s

13s

38s

40s

39s

44s

38s

39s

40s

41s

38s

41s

42s

39s

Chloroflexus aurantiacus

cau

1h 10min 57s

05min 23s

31s

40s

08min 37s

02min 24s

02min 36s

06min 39s

06min 37s

02min 28s

02min 36s

06min 35s

06min 55s

02min 28s

02min 36s

06min 46s

07min 05s

Bifidobacterium breve

bbv

16min 52s

07s

23s

31s

40s

05min 43s

46s

01min 21s

40s

44s

42s

01min 18s

41s

44s

47s

01min 23s

Corynebacterium glutamicum

cgl

32min 15s

10s

05min 27s

27s

04min 19s

01min 07s

01min 23s

01min 27s

06min 28s

01min 08s

01min 23s

01min 30s

01min 37s

01min 08s

01min 23s

01min 34s

01min 43s

Mycobacterium tuberculosis

mtv

1h 04min 27s

14s

05min 56s

05min 53s

01min 19s

03min 47s

04min 14s

03min 57s

04min 41s

04min 19s

04min 04s

03min 57s

04min 25s

04min 21s

04min 15s

04min 12s

04min 52s

Streptomyces coelicolor

sco

2h 19min 05s

18s

10min 33s

40s

05min 17s

08min 56s

18min 32s

13min 20s

08min 44s

08min 58s

08min 17s

13min 28s

08min 31s

08min 54s

08min 46s

08min 16s

07min 36s

Deinococcus radiodurans

dra

27min 15s

11s

18s

23s

35s

01min 06s

01min 23s

01min 32s

02min 59s

06min 05s

01min 24s

01min 27s

02min 51s

01min 04s

01min 24s

01min 30s

03min 02s

Thermus thermophilus

tth

22min 47s

05min 11s

16s

26s

34s

49s

52s

01min 10s

02min 31s

51s

55s

01min 09s

02min 33s

50s

58s

01min 11s

02min 31s

Fimbriimonas ginsengisoli

fgi

35min 04s

10s

01min 29s

05min 12s

16s

01min 57s

03min 09s

01min 53s

01min 59s

02min 05s

03min 16s

01min 59s

02min 02s

02min 07s

03min 22s

02min 02s

02min 07s

Acetomicrobium mobile

amo

29min 07s

09s

05min 16s

17s

05min 17s

40s

02min 04s

05min 43s

48s

41s

02min 04s

44s

50s

42s

02min 12s

48s

51s

Thermotoga maritima

tmm

38min 47s

01min 00s

12min 59s

05min 15s

20s

01min 27s

03min 28s

42s

48s

01min 24s

03min 21s

42s

50s

01min 29s

03min 26s

44s

50s

Caldisericum exile

cex

06min 27s

06s

09s

21s

25s

29s

43s

21s

25s

28s

42s

21s

25s

30s

43s

Dictyoglomus thermophilum

dth

17min 30s

09s

05min 12s

12s

15s

33s

38s

42s

02min 02s

33s

38s

41s

01min 58s

33s

39s

43s

02min 02s

Fibrobacter succinogenes

fsu

14min 48s

09s

05min 09s

07s

10s

48s

45s

46s

48s

46s

45s

43s

49s

46s

Gemmatimonas aurantiaca

gau

43min 42s

05min 13s

01min 00s

05min 18s

30s

01min 33s

02min 18s

01min 40s

03min 07s

01min 33s

06min 38s

02min 12s

03min 35s

01min 34s

01min 40s

02min 18s

03min 33s

Chlorobium phaeobacteroides

cph

41min 17s

08s

44s

05min 20s

53s

04min 19s

06min 02s

01min 14s

56s

04min 28s

01min 01s

01min 14s

05min 55s

05min 58s

01min 02s

01min 18s

Bacteroides fragilis

bfr

42min 15s

10s

06min 07s

05min 26s

30s

02min 07s

03min 03s

02min 25s

02min 24s

02min 09s

03min 03s

02min 20s

02min 25s

02min 11s

03min 03s

02min 24s

02min 29s

Rhodopirellula baltica

rba

1h 02min 59s

14s

05min 27s

31s

39s

03min 25s

03min 21s

03min 27s

03min 48s

10min 07s

03min 33s

03min 35s

03min 42s

10min 09s

03min 36s

03min 43s

03min 44s

Chlamydia pneumoniae

cpn

07min 38s

06s

05min 06s

06s

07s

10s

11s

12s

10s

12s

11s

12s

13s

Opitutus terrae

ote

40min 49s

12s

19s

32s

05min 49s

02min 11s

02min 19s

02min 25s

04min 35s

02min 10s

02min 12s

02min 29s

04min 23s

02min 10s

02min 18s

02min 35s

04min 09s

Borrelia burgdorferi

bbn

01min 35s

03s

04s

03s

06s

07s

06s

07s

06s

07s

Elusimicrobium minutum

emi

05min 31s

07s

09s

10s

14s

20s

22s

24s

28s

21s

23s

25s

29s

20s

23s

24s

32s

Helicobacter pylori

heo

12min 19s

07s

05min 08s

08s

13s

22s

24s

25s

27s

24s

26s

01min 16s

23s

25s

28s

01min 17s